Après deux actions en 2019 et 2020 qui mélaient des sessions de type "formation introductive" (notamment au développement R, au développement R Shiny, au développement d'outils Galaxy), avec d'autres de type "travail collaboratif / collaboration fest / hackathon", cette année nous proposons 2 jours complets de "travail collaboratif / collabroation fest / hackathon" avec en fonction des demandes, des sessions parallèles de "formation introductive" (notamment au développement R, au développement R Shiny, au développement d'outils Galaxy).
L'événement se déroulera principalement à Concarneau et afin de faciliter la participation du plus grand nombre, un "site connecté" sera mis en place grâce à l'aide des collègues du MNHN au jardin des plantes Paris et au CESAB de la FRB, à Montpellier.
Dans les sujets mis sur la table vous trouverez notamment :
- le développement d'applications R Shiny (pour de la visualisation, saisie de données ou autre)
- la mise à disposition de scripts R (et autres languages) via le web pour une réutilisation ne nécéssitant pas de connaissance en programmation ou dans l'utilisation d'un cluster de calcul via l'initiative Galaxy-E et/ou les solutions Galaxy-Bricks et/ou R shiny
- le déveoppement de fonctionnalités d'interaction avec des entrepôts (dataverse) et/ou catalogues de données et/ou métadonnées (geonetwork/metacat/geonature)
- le développement de nouvelles instances "Galaxy-Bricks" (Python/Django/Galaxy) et/ou de son "moteur" basé sur NGPhylogeny afin de faciliter l'accès à des données, à des codes sources et à de l'infrastructure de calcul HPC via une interface graphique et une expérience utilisateur dédiée à un groupe d'utilisateurs spécifique
- le développement de fonctionnaltiés de crowdsourcing / annotation de données par la foule (notamment données acoustiques / photos / vidéos)
- l'amélioration de codes pour permettre une meilleure parallélisation quand utilisés sur cluster HPC
- l'utilisation du language Julia en écologie
- ...
N'hésitez pas à utiliser le formulaire de contact pour toute question / toute proposition de sujets !
Lien vers les prises de notes effectuées durant l'événnement : https://codimd.math.cnrs.fr/JHvcOt40QEO75MBt2y2vsg?view
Liens vers présentations utilisées lors de l’événement :
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